Як вбачається з реєстру судових рішень, у червні 2016 року було розпочато кримінальне провадження за ознаками кримінального правопорушення, передбаченого ч.1 ст.375 КК України (постановлення завідомо неправосудного рішення). Кримінальне провадження стосується факту винесення суддею незаконної ухвали, якою було порушено справу про банкрутство ПАТ "ДАТ "Чорноморнафтогаз".

За інформацією з веб-сайту "24 канал" та реєстру судових рішень, Печерський районний суд м. Києва відмовився обирати запобіжний захід у вигляді особистого зобов’язання для Яковенко А. В., просто зобов’язавши її прибувати за кожною вимогою до слідчого прокурора або до суду.

Окрім того, з реєстру судових рішень також випливає, що у травні 2017 року прокуратура подавала клопотання про звільнення судді від кримінальної відповідальності у зв’язку із зміною обстановки. На думку прокуратури, зміна обстановки полягала у тому, що злочин, у якому підозрюється суддя, втратив суспільну небезпечність через скасування ухвали Київським апеляційним господарським судом. Однак задоволення такого клопотання можливе за умови встановлення вини особи у вчиненні злочину. У зв’язку з тим, що суддя себе винною не визнала, то у задоволенні такого клопотання було відмовлено.  

За інформацією видання "Наші гроші" та відомостей з реєстру судових рішень, суддя Яковенко А. В. винесла ухвалу про порушення провадження у справі про банкрутство ПАТ "ДАТ "Чорноморнафтонгаз" всупереч Закону України "Про трубопровідний транспорт", яким встановлено заборону на порушення справ про банкрутство відносно підприємств, заснованих НАК "Нафтогаз України".

У подальшому Київський апеляційний господарський суд скасував вищевказану ухвалу з підстав порушення Закону України "Про трубопровідний транспорт".