За версією слідства, суддя нібито не вніс до електронних декларацій за 2015–2016 роки відомості про транспортні засоби та об’єкти нерухомості, які перебувають у нього в користуванні, а також про майно, що перебуває у власності та користуванні його колишньої дружини, на загальну суму понад 17 млн грн.  Як зазначається в повідомленні, подружжя розірвало шлюб у 2011, але надалі проживали однією сім’єю, а отже відомості про неї мали відображатись у майновій декларації судді. Також в НАБУ зазначають, що перебуваючи на посаді судді, Євген Самойленко набув у власність активи, законність підстав набуття яких не підтверджена доказами й вартість яких значно перевищує його доходи.  Однак, у лютому 2019 року, Конституційний Суд України визнав статтю 368-2 Кримінального кодексу України (незаконне збагачення) такою, що не відповідає Конституції України. У зв'язку з цим кримінальне провадження у цій частині підлягає закриттю.